凱杰Qiagen微量樣本全基因組擴增試劑盒
150025 凱杰Qiagen微量樣本全基因組擴增試劑盒REPLI-G Kits 100T/盒,產品介紹:產品品牌:Qiagen產品貨號:150025 產品名稱:微量樣本全基因組擴增試劑盒 英文名稱:REPLI-G Kits 產品規格:100T/盒
凱杰Qiagen150025微量樣本全基因組擴增試劑盒REPLI-G Kits 100T/盒
凱杰QIAGEN在生命科學研究、應用檢測、制藥、和分子診斷領域獲得成功和突破性進展。
150025 凱杰Qiagen微量樣本全基因組擴增試劑盒REPLI-G Kits 100T/盒,產品介紹:
產品品牌:Qiagen
產品貨號:150025
產品名稱:微量樣本全基因組擴增試劑盒
英文名稱:REPLI-G Kits
產品規格:100T/盒
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150025 凱杰Qiagen微量樣本全基因組擴增試劑盒REPLI-G Kits 100T/盒,產品說明:
DNA Polymerase, Buffers, and Reagents for 100 x 50 µl whole genome amplification reactions (typical yield 10 µg per reaction)
用于 100 x 50 μl 全基因組擴增反應的 DNA 聚合酶、緩沖液和試劑(每次反應的典型產量為 10 μg)
特征
l 擴增的 DNA 可用于 NGS、微陣列和 PCR 應用
l 等溫多重位移擴增 (MDA) 與校對 DNA 聚合酶
l 全基因組擴增 (WGA) 可從 10 ng DNA 中產生 7 至 40 μg 擴增的 DNA
l 超快格式,可在 1–1.5 小時內完成全基因組擴增
l 適用于 96 個樣品的高通量形式,處理時間僅為 20 分鐘
產品詳情
由于基因組DNA數量不足而可以進行的基因組分析的數量和類型的限制可以通過對樣本中所有DNA進行全局擴增(全基因組擴增)來克服。REPLI-g 試劑盒提供 DNA 聚合酶、緩沖液和試劑,用于高度均勻的全基因組擴增,序列偏差*小,可與各種起始材料一起使用,包括基因組 DNA、新鮮或干燥血液、口腔拭子、新鮮或冷凍組織和細胞。QIAGEN REPLI-g試劑盒有幾種不同的尺寸和配置,使研究人員能夠為其應用和實驗室空間構建優良工作流程。典型的 REPLI-g 產量范圍約為 7 μg 至 40 μg 擴增 DNA,具體取決于所使用的試劑盒和工作流程。
REPLI-g Mini 和 Midi 試劑盒提供單管工作流程,具有更高的擴增 DNA 產量,而 REPLI-g UltraFast 試劑盒可在短短 60–90 分鐘內實現高度均勻和準確的全基因組擴增。對于 96 孔形式的高通量處理,REPLI-g 篩選試劑盒的簡化室溫程序可實現簡單的液體處理,僅需 20 分鐘。REPLI-g 篩選試劑盒旨在使用一系列基因分型、PCR、測序或微陣列檢測進行快速篩選。
Performance
各種樣品的高產量,適用于多種應用
各種臨床和非臨床研究樣品可與 REPLI-g 迷你和中型試劑盒一起使用,包括基因組 DNA、新鮮或干燥血液、新鮮或冷凍組織和細胞。每 50 μl 反應的典型 DNA 產量始終達到 10 μg(迷你試劑盒)或 40 μg(中型試劑盒),而無論模板DNA的數量如何,通常都能實現擴增DNA的均勻產量,從不同的模板濃度中獲得均勻的DNA產量始終很重要,但對于高通量應用尤其重要,這需要后續的遺傳分析,而無需額外測量或調整DNA濃度。
對于標準質量樣品,REPLI-g 超快迷你試劑盒的平均 DNA 產量為 90 分鐘內每 20 μl 反應 7–10 μg。如果時間非常有限,只需45分鐘即可獲得足夠的產品進行下游遺傳分析,陰性對照樣品(無模板DNA)不會擴增,從而提供樣品存在/不存在或污染DNA的可靠指標
REPLI-g 篩選試劑盒反應的典型 DNA 產量為每 40 μl 反應 8 μg。擴增的DNA可直接用于各種下游應用,包括基因分型(例如SNP、STR、缺失和插入)、終點PCR、定量實時PCR、微陣列和測序。與其他需要在冰上進行反應設置的全基因組擴增程序不同,REPLI-g 篩選試劑盒使用室溫設置,處理時間僅為 20 分鐘,特別適合并行處理多個樣品。從不同的模板濃度中獲得均勻的DNA產量對于高通量應用尤為重要,因為無需測量或調整DNA濃度即可進行后續遺傳分析。平均產品長度通常大于 10 kb,范圍在 2 kb 到 100 kb 之間
REPLI-g擴增DNA的平均產物長度通常超過10 kb,范圍在2 kb至100 kb之間,因此可以進行復雜的限制性內切酶分析和長距離PCR等下游應用。REPLI-g擴增的DNA非常適合基因分型應用,例如使用TaqMan®引物/探針組進行SNP基因分型,測序和STR/微衛星分析。
研究人員反饋
“在過去的兩年中,我們一直在多個項目中廣泛使用REPLI-g超快速迷你套件。使用 REPLI-g 試劑盒進行的多次置換擴增能夠以非常低的錯誤率和高覆蓋率忠實地擴增所有 DNA 產物。我們使用該試劑盒的下游應用通常包括NGS,但也包括qPCR和微陣列。此外,我們正在努力在微流體或芯片實驗室系統中實施這項技術,因為該方法不需要復雜的熱循環程序。 范蓉博士,美國耶魯大學生物醫學工程助理教授。
成功用于二代測序
許多出版物已經證明了REPLI-g擴增DNA在下一代測序(NGS)應用中的成功應用,從腫*細胞的外顯子組和全基因組測序到宏基因組學研究,再到單細胞分析(有關在NGS中成功使用REPLI-g的一系列新出版物,請參閱我們的WGA資源頁面).由于全基因組擴增DNA在NGS和陣列應用中的使用一直存在爭議,我們檢測到可能影響在這些下游應用中使用擴增DNA成功的潛在因素。我們確定輸入材料的質量強烈影響下游NGS實驗的成功。如果使用低質量的DNA(例如,降解的DNA)或老化的組織材料,則所得擴增的DNA可能無法給出可靠的結果(數據未顯示)。然而,WGA使用REPLI-g技術對完整細胞或未降解的純化DNA表明,NGS結果與純化的gDNA獲得的結果相當。基因組位點序列的序列覆蓋率和比對比較表明WGA后垃圾DNA的水平最小化,而擴增和基因組DNA的錯誤率處于相似的百分比范圍內。QIAseq FX 單細胞 RNA 和 QIAseq FX 單細胞 DNA 文庫試劑盒利用 REPLI-g MDA 反應獲得高質量的 NGS 文庫,當起始處理 10 pg – 1 ng 的 RNA 或 DNA 時。
高保真全基因組擴增
REPLI-g 技術可在整個基因組中提供高度均勻的 DNA 擴增。Phi29聚合酶可以復制高達70 kb,而不會與基因組DNA模板解離。與基于 PCR 的全基因組擴增 (WGA) 技術相比,Phi29 聚合酶具有 3'→5' 核酸外切酶校對活性,并且在復制過程中保持高達 1000 倍的保真度。試劑盒中提供的核酸外切酶抗性引物可確保DNA產物的高產量,并且WGA緩沖液系統針對超長讀取長度和無偏位點表示進行了優化。
REPLI-g 優于基于 PCR 的 WGA 方法
傳統的基因組DNA擴增方法包括創建EBV轉化細胞系的耗時過程,然后使用隨機或退化寡核苷*引發的PCR進行全基因組擴增。此外,其他供應商通常使用的基于PCR的方法(例如DOP-PCR和PEP)會產生非特異性擴增偽影,并且無法wan全覆蓋位點。在某些情況下,可能會產生長度小于 1 kb 的 DNA,而這些 DNA 不能用于許多下游應用。通常,由于使用了低保真酶Taq DNA聚合酶,生成的DNA具有更高的突變率,這可能導致容易出錯的擴增,例如導致單堿基對突變,STR收縮和擴增。與這些缺點相反,REPLI-g在整個基因組中提供了高度均勻的擴增,在擴增過程中具有*小的基因座偏差和*小的突變率
Principle
放大原理
通常缺乏足夠數量的基因組DNA進行基因組分析,從而限制了可以執行的分析。全基因組擴增(WGA)通過擴增樣品中的整個基因組來克服這一限制,提供足夠的數量來對同一DNA樣品進行所有分析。REPLI-g技術在整個基因組中提供高度均勻的DNA擴增,并且序列偏差最小。
該方法基于多重位移擴增(MDA)技術,該技術使用等溫基因組擴增和du特的合成Phi 29聚合酶,能夠在不與基因組DNA模板解離的情況下復制高達100 kb.Phi 29聚合酶在存在核酸外切酶抗性引物的情況下使用,以實現DNA產物的高產量,具有3'→5'核酸外切酶校對活性,保真度比Taq聚合酶高1000倍,可在復制過程中保持高保真度。在du特、優化的 REPLI-g 緩沖液系統的支持下,Phi 29 聚合酶可輕松求解發夾環等二級結構,從而防止聚合酶在擴增過程中滑移、停止和解離。這使得能夠產生高達100 kb的DNA片段,而不會出現序列偏差。
DNA的堿性變性
基因組DNA在用于酶擴增程序之前必須變性,這通常使用苛刻的方法完成,例如在高溫下孵育(熱孵育)或增加pH值(化學堿性孵育)。REPLI-g 試劑盒使用溫和的堿性孵育,允許均勻的 DNA 變性,具有非常低的 DNA 片段化或非堿性位點的生成。這導致擴增的DNA具有非常高的完整性,并zui大化擴增片段的長度,從而使基因組位點和序列得到均勻的表示。使用REPLI-g試劑盒,在后續下游應用中可確保可靠的結果,沒有假陽性或假陰性數據,這與使用熱誘導變性的其他WGA技術不同,WGA技術會破壞模板DNA,導致位點偏倚和代表性不足。
Procedure
REPLI-g Mini和MIDI試劑盒使用一種簡單可靠的方法,從少量分離的靶基因組DNA或直接從全血、干血卡、血沉棕黃層和組織培養細胞中實現準確的基因組擴增。加入裂解緩沖液,既裂解樣品材料又使DNA變性,然后進行短時間的分鐘孵育。中和后,加入預混液(包括REPLI-g迷你DNA聚合酶),等溫擴增反應在30°C下進行過夜。
使用 REPLI-g 超快迷你試劑盒擴增基因組 DNA 涉及 3 個基本步驟。首先,樣品(10 ng純化的基因組DNA,0.5μl全血或300個組織培養細胞)經歷溫和的堿性變性,避免模板DNA的碎裂和損壞。接下來,將樣品中和,最后在30°C下與REPLI-g超快DNA聚合酶一起孵育。 擴增的DNA在60分鐘后即可使用,無需進一步純化。
非??焖?、簡單和準確的 REPLI-g 篩選方法能夠對多個基因組樣本進行平行擴增,如 REPLI-g 篩選手冊中所述。裂解樣品材料,并通過在1°C下與緩沖液SB65孵育使DNA變性。 通過冷卻至室溫來停止變性。加入緩沖液SB2和DNA聚合酶,等溫擴增進行至少10小時或在30°C下過夜。
整個反應設置在室溫下進行,因此易于與液體處理儀器一起使用。96 個樣品的反應設置僅需 20 分鐘,節省了專注于其他重要任務的時間。REPLI-g篩選試劑盒結合了許多功能,使其非常適合用于手動或自動高通量突變篩選,包括用于提高準確性的大容量移液步驟,與96孔微孔板兼容,以及簡化的方案,以實現快速簡便的設置。
從我們完整的專用 REPLI-g 產品中選擇zuishihe您特定要求的 REPLI-g 試劑盒
Applications
l REPLI-g擴增的基因組可用于各種下游應用,包括:
l 使用 TaqMan® 引物/探針組進行 SNP 基因分型
l 基于 qPCR 和 PCR 的突變檢測
l 二代測序
l 可疑交易報告/微衛星分析
l 桑格測序
l RFLP 和 Southern 印跡分析
l 陣列技術,如比較基因組雜交
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